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两个印度香米品种的研究人员正在序列基因组

历史上,根据形态学差异和分子标记,该物种被分为两个主要的变种组:粳稻和in稻。这些品种组可被视为亚种,特别是考虑到它们之间存在生殖屏障。

Archaeobotanical遗体建议粳水稻驯化9000年前在中国的长江流域,而籼稻大米4000年前起源驯化时等位基因从引进粳稻到无论是尼伐拉稻或proto-籼稻在印度次大陆。

最近,两个附加的各种基团已被认识到,从遗传上不同粳稻和籼:的AU / circum-AUS和芳香族/ circum巴斯马蒂米。

在其成员中,circum-basmati集团拥有来自南亚的标志性印度香米和来自伊朗的Sadri大米。

尽管具有重要的经济和文化意义,但目前仍缺乏高质量的参考基因组,该群体的进化史尚未得到完全解决。

“水稻是世界上最重要的主食作物之一,而印度香米(Basmati)组的品种是最具标志性和珍贵的水稻品种,”基因组和系统生物学中心的博士后Jae Young Choi博士说。纽约大学生物系。

“但是,直到最近,印度香米的高质量参考基因组还不存在。”

来自纽约大学,牛津纳米孔技术和纽约基因组中心的Choi博士及其同事使用纳米孔测序技术对两个印度香米品种的基因组进行了测序。

研究人员的研究重点是来自巴基斯坦的Basmati 334,该植物耐旱并能抵抗水稻杀灭白叶枯病,以及来自伊朗的Dom Sufid,这是市场上最昂贵的芳香长粒大米之一。

秒速飞艇官网利用纳米孔测序的长读,科学家们组装了高质量,完整的Basmati 334和Dom Sufid基因组,这与使用短读组装的早期基因组序列相比有了重大改进。

测序还证实了印度香米是其他两个水稻品种的杂交品种。巴斯马蒂的大部分遗传物质来自粳稻,其次是稻米。

该研究的作者现在计划与科学和水稻育种界合作,以鉴定重要基因,了解使巴斯马蒂族群与众不同的原因,甚至开发出分子标记来帮助育种新品种。

纽约大学的迈克尔·普鲁加南(Michael Purugganan)说:“通过拥有能够抵抗干旱条件和抵抗白叶枯病的水稻品种(如巴斯马蒂334)的序列,我们可以开始鉴定出产生这些宝贵性状的基因。”

“考虑到气候变化带来的挑战以及对全球粮食安全的影响,耐旱性是我们特别感兴趣的。”

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